iPhone 3GS ถือเป็นมือถือตัวล่าสุดจากทาง Apple ซึ่งมันถูกติดตั้งระบบปฏิบัติการตัวใหม่ล่าสุดเล่นกัน นั้นคือ OS 3.0 firmware โดยผู้ที่ใช้งาน iPhone 3G ซึ่งเป็น OS 2.0 นั้นสามารถอัพเกรดได้โดยไม่ต้องเสียค่าใช้จ่ายใดๆเพิ่มเติม ส่วนผู้ที่ใช้ iPod Touch นั้นจะต้องเสียค่าใช้จ่ายในการอัพเกรดราวๆ $10 โดยทาง Apple นั้นเปิดให้ทำการ ดาวโหลด OS 3.0 เมื่อวันที่ 17 มิถุนา ที่ผ่านมา แต่ถึงยังไงก็ตามก็ยังไม่น่าที่จะรีบร้อยอัพเกรด เนื่องจากอาจจะเกิดปัญหาระหว่างอัพเกรดเนื่องจากมีผู้ดาวโหลดพร้อมๆกันทั่วโลก สิ่งที่น่าสนใจใน OS 3.0 นั้นก็ได้แก่